Laboratoire 

Biodiversité microbienne et fonctionnement des écosystèmes aquatiques :Rôle de la diversité microbienne dans le fonctionnement des systèmes aquatiques
Etude de la diversité à  différents niveaux (spécifique et fonctionnel) des réseaux trophiques microbiens Responsable: Gérard FONTY
Tél : 04.73.40.74.60
Fax : 04.73.40.76.70
Gerard.FONTY@univ-bpclermont.fr

* Impact des virus dans la dynamique de la biodiversité microbienne en milieu aquatique,

Effet des ressources et de la prédation sur la structure et la diversité des communautés bactériennes, la diversité bactérienne étant évaluée à l'aide de techniques de biologie moléculaire,

* Rôle des microparticules organiques d'origine détritique (TEP, CSP, PJD) dans la formation de microhabitats et la dynamique de la diversité spécifique et fonctionnelle des communautés de bactéries et de protozoaires,

* Intérêt de l'utilisation de marqueurs organiques naturels (acides gras) et des rapports d'isotopes stables ( C13, N15 ) pour connaître la diversité des composés biochimiques mis à la disposition des prédateurs et tracer les flux de matière dans les réseaux trophiques,

* Etude de la diversité spécifique et fonctionnelle des communautés microbiennes se développant dans les milieux aquatiques anaérobies.

Cytosquelette et Morphogenèse des Protistes

Cytosquelette et morphogenèse chez les Ciliés

* Réseaux filamenteux, épiplasme et distribution d'un matériel péricinétosomien

Responsable: Bernard VIGUES
Tel : 04.73.40.74.69
Fax : 04.73.40.76.70
Bernard.vigues@univ-bpbclermont.fr

Le cytosquelette et sa dynamique chez un Flagellé Trichomonas vaginalis

- Thèmes : cytosquelette, ultrastructure, systématique, phylogenie, biodiversité flagellés
- Espèces utilisées : groupes Parabasalia, Diplomonadines, Retortomonadines, Oxymonadines, flagellés de termites, blattes et quelques autres groupes de flagellés et mastigamibes
- Techniques : microscopie électronique à transmission, immunofluorescence

Ecotoxicologie microbienne Etude de la qualité de l'eau.
Détermination du potentiel toxique de molécules isolées ou de rejets industriels à l'aide de microbiotests.
Prévision de l'impact d'une pollution organique ou minérale sur un système épuratoire récepteur.
Modification de la biodiversité microbienne.

Responsable: Jacques BOHATIER
Tél : 04.73.40.74.73
Fax : 04.73.40.76.70.
Jacques.bohatier@univ-bpclermont.fr

Génomique intégrée des Interactions microbiennes  Compréhension des mécanismes d'adaptation des populations microbiennes du sol suite à des contaminations par des polluants.
Caractérisation des espèces microbiennes et des voies métaboliques par des approches bioinformatique, génomique et post-génomique (biopuces ADN oligonucléotidiques

Responsable Pierre PEYRET
Tél : 04.73.40.76.04
Fax : 04.73.40.76.70
Pierre.PEYRET@univ-bpclermont.fr

Parasitologie moléculaire et cellulaire

la microsporidie Encephalitozoon cuniculi

Responsable: Christian VIVARES
Tél : 04.73.40.74.57
Fax : 04.73.40.76.70.
christian.vivares@univ-bpclermont.fr

Département Régulations, Développement, Diversité Moléculaire

Responsable: Philippe Grellier

Tél: (33).1.40.79.35.10

Fax:(33).1.40.79.34.99

grellier@mnhn.fr

Thèmes de recherche:

Biologie cellulaire et moléculaire, parasitologie, biomédecine Espèces utilisées:Plasmodium, Trypanosomes

Techniques maitrisées:

IF, Microscopie confocale, déconvolution, biochimie des protéines, chromatographie, biologie moléculaire, criblage différentiel, ARN interérence, expression en systèmes hétérologues, cultures cellulaire et parasitaire, tests de molécules antiparasitaires (in vitro et in vivo)

Laboratoire de Génétique et Pathologie (LGP)

OIE Reference Laboratory for marteiliosis and bonamiosis

EU Community Reference Laboratory for diseases of molluscs Responsable:

Isabelle Arzul

Tel: (33) 5 46 76 26 10 (switchboard) or 47 (direct line)

Fax : (33) 5 46 76 26 11

iarzul@ifremer.fr

Thèmes :

Biologie cellulaire et moléculaire, évolution, environnement

Espèces utilisées :

Parasites des Mollusques bivalves marins

Techniques maîtrisées :

Histologie, microscopie électronique à transmission, immunologie, biologie moléculaire, pathologie expérimentale

Différenciation cellulaire

Responsables:

Loïc Morin et Anne BAROIN
Tél: 01 69 15 64 84

Fax: 01 69 15 68 03 
loic.morin@ibaic.u-psud.fr

Protiste étudié:

Sterkiella histriomuscorum

Thèmes de recherche
Mécanismes moléculaires liès au cycle enkystement / dekystement.

Techniques et gros matériel
Biologie moléculaire, Construction de banques génomiques et de banques d'expression ; criblage différentiel.

Morphogénèse et cytosquelette

Responsable: Pascale Dupuis-Williams

tel: 33 1 69158160

fax: 33 1 69156803

pascale.dupuis-williams@ibaic.u-psud.fr

Groupe de protiste étudié:

Paramecium 

Thèmes de recherche:
Analyse fonctionnelle de l'assemblage des corps basaux et structures associées.

Techniques et gros matériel:
Biologie moléculaire, RNAi, GFP-tagging, immunocytochimie, imagerie confocale, spectrométrie de masse.

Personne à contacter :

Jean-Pierre Dedet

tel. : 33 (0)4 67 63 27 51

fax : 33 (0)4 67 63 00 49

parasito@univ-montp1.fr

Thèmes de recherche:

Génomique structurale et fonctionnelle des Protozoaires parasites; biologie moléculaire et cellulaire

Espèces utilisées:

Leishmania

Techniques maitrisées:

Biologie moléculaire, banques génomiques, séquençage, transfection, caryotypes moléculaires, microscopie à fluorescence, cultures de protozoaires.

Personne à contacter:

Eduardo Dei-Cas

Thèmes:

(1) Epidémiologie moléculaire des pneumocystoses;

(2) Epidémiologie moléculaire des cryptosporidioses;

(3) Epidémiologie moléculaire des aspergilloses et d'autres mycoses profondes à champignons filamenteux

.
Espèces utilisées:

Pneumocystis spp ., Cryptosporidium spp ., Aspergillus spp. et autres pathogènes genres de pathogènes fongiques.

Régulation de l'expression de gènes plasmodiaux Catherine Vaquero vaquero@ext.jussieu.fr

Identification de cibles vaccinales et thérapeutiques Dominique Mazier mazier@ext.jussieu.fr

Responsable: A. GORENFLOT
Tel: 04 67 54 64 81

Fax: 04 67 54 66 21
agorenf@pharma.univ-montp1.fr

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Babesia, Leishmania 

Thèmes de recherche
Biologie cellulaire, Parasitologie, Biotechnologie, Biomédecine 

Techniques et gros matériel
Biochimie des protéines: électophorèse, immunoblotting, immuoprécipitation, Biologie moléculaire: *banques d'ADN, anticorps recombinants, PCR, séquençage 

Biogénèse Membranaire et Phospholipides:

biosynthèse, dynamique pharmacologie, génétique moléculaire, application à la chimiothérapie du paludisme.

Responsable: Henri VIAL
Tel: 04 67 14 42 87

Fax: 04 67 14 82 86
agorenf@pharma.univ-montp1.fr

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Plasmodium falciparum 

Thèmes de recherche
Biologie cellulaire, Biochie du métabolisme, Pharmacologie, Chimiothérapie 

Techniques et gros matériel
Biologie cellulaire, Biochimie. Analyse des lipides, clonage des gènes et expression en systèmes hétérologues (bactérie, levure, baculo-virus). Pharmacologie. Tests de drogues antipaludiques (in vitro et in vivo) et détermination des propriétés pharmaco cinétiques

Responsable: Dr Loïc FAVENNEC
Tel: 02 32 88 80 15

Fax: 02 32 88 80 17
loic.favennec@wanadoo.fr

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Cryptosporidium, Giardia, Acanthamoeba 

Thèmes de recherche
Parasitologie, Chimiosensibilité, Physiopathologie, Environnement 

Techniques et gros matériel

Responsable:

Fred OPPERDOES
Tel: 32-2-764 74 39

Fax: 32-2-762 68 53
opperdoes@trop.ucl.ac.be

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Trypanosoma, Leishmania, Phytomonas, Crithidia 

Thèmes de recherche
Biologie cellulaire et moléculaire, évolution, parasitologie 

Techniques et gros matériel
Dosages enzymatiques, fractionnement subcellulaire, surexpression des protéines, séquençage et clonage des gènes, méthodes phylogénétiques 

Responsable: Michel Tibayrenc

Tél.  04 67 41 61 97; (secrétaire)

04 67 41 62 07; (direct)  

06 08 24 08 81 (portable)

Michel.Tibayrenc@mpl.ird.fr

Michel Tibayrenc: Rédacteur en Chef Infection, Genetics and Evolution (Elsevier) http://www.elsevier.com/locate/meegid

Responsable: M.L. DARDE
Tel: 05 55 05 61 60

Fax: 05 55 05 61 77
darde@unilim.fr

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Toxoplasma, Trypanosoma brucei  Thèmes de recherche
Parasitologie, Biotechnologies, biomédecine, Biodiversité 

Techniques et gros matériel
IF, ELISA, Western-Blot, Iso focalisation, analyse isoenzymatique, cultures cellulaires, microscopie électronique, IME. 

Responsable: Heinz MEHLHORN
Tel: 0211/8113052

Fax: 0211/8114499
mehlhorn@uni-duesseldorf.de

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Theleria, Babesia, Sarcocystis, Eimeria  , Plasmodium, Giardia, Trichomonas, Leishmania, Sarcocystis, Toxoplasma

Techniques et gros matériel
Microscopie photonique, microscopie électronique à transmission et à balayage, cultures, tests de médicaments 

Responsable: Dominique LE RAY
Tel: 32 -(0)3-24 76 355

Fax: 32-(0)3-24 76 362
dleray@proto.itg.be

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Trypanosomiases et leishmanioses  Thèmes de recherche
Médecine tropicale, parasitologie 

Techniques et gros matériel
- Surveillance et contrôle sur terrain (Amérique Latine, Asie, Afrique)
- Transmission par insectes vecteurs
- Caryotypes moléculaires, RFLP, PCR, RAPD, séquençage, librairies génomiques, expression.... 

Responsable:

Bhen Sikina TOGUEBAYE
Tel: 221 25 25 29

Fax: 221 25 25 29
  Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Microsporidies, Coccidies, Myxosporidies  Thèmes de recherche
Parasitologie 

Techniques et gros matériel
Microscopie électronique 

Responsable: Jiri LOM
Tel: 00420 38 817

Fax: 00420 47 743
lom@paru.cas.cz

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Protistes parasites des poissons  Thèmes de recherche
Parasitologie 

Techniques et gros matériel
Microscopie photonique et électronique... 

Responsable: Michel MIEGEVILLE
Tel: 02 40 08 40 74

Fax: 02 40 08 41 14
michel.miegeville@Sante.univ-nantes.fr

Groupe de protistes étudiés ou écosystème
Microsporidies humaines et environnement 

Thèmes de recherche
Parasitologie, Environnement 

Techniques et gros matériel
Microscopie électronique à balayage, cultures cellulaires, PCR, sonde générique et sondes spécifiques de Microsporidies, Ag anténatal de la toxoplasmose (PCR, cultures cellulaires) 

Responsable:

Maria del Pilar GRACIA ROYO
Tel: 34-3-40 21 437

Fax: 34-3-41 10 887
pgracia@porthos.bio.ub.es

Groupe de protistes étudiés ou écosystème:
Ciliés libres d'eaux douces, épuration d'eaux usées, Microsporidies parasites de poissons, Foraminifères posidonicoles 

Thèmes de recherche:
Biologie cellulaire, parasitologie, environnement 

Techniques et gros matériel :
Techniques d'imprégnation argentique, d'histologie, microscopie électronique à transmission et à balayage, épifluorescence- Techniques d'analyse des eaux, chromatographie phase gaz-Cytométrie de flux et d'image, Analyse digitale des images-Pulsed field gel electrophoresis