Groupement des Protistologues de Langue Française

GPLF-INFOS 22 Février 2008 Siège social: Laboratoire Microorganismes: Génome et environnement (LMGE), Complexe Scientifique des Cézeaux. Université Blaise Pascal de Clermont-Fd 63177 AUBIERE Cedex, France gplf@univ-bpclermont.fr

 

 

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- EDITORIAL -

Le passage à l’année 2008 est marqué par le changement partiel de la composition du bureau du GPLF. Je voudrais profiter de cette transmission pour remercier chaleureusement Isabelle qui a assumé avec beaucoup d’enthousiasme la responsabilité des orientations de notre société pendant ces 4 dernières années. Au passage, et de manière non exhaustive, je voudrais rappeler notre adhésion à la Fédération Réaumur des Sciences du Vivant en 2004, ainsi qu’à la Fédération des Sociétés Européennes de Protistologie en 2007, de même que la modernisation de notre site et de sa base de données, et la tenue de nos congrès chez nos collègues des pays francophones. Je souhaite poursuivre dans la voie de ces orientations, marquées par le désir d’ouverture à l’extérieur, et ceci dans un contexte de remaniement de nombreuses structures de recherche, qui affectent nos laboratoires et donc les membres de notre société. La mobilité accrue des chercheurs est peu favorable à leur participation à l’activité des sociétés nationales, et nous nous devons d’accompagner ce mouvement en multipliant les contacts internationaux : le site du GPLF pourrait ainsi par exemple constituer une « bourse » centralisée des offres de stages de nos laboratoires, mais aussi de nos collègues de l’étranger. Le besoin de visibilité de notre société peut aussi être satisfait par notre participation à l’enrichissement des projets de mise en ligne de collections d’images du type EOL (Encyclopedy Of Life), voire à promouvoir des contacts avec les structures « médiatiques » pour réaliser des films grand public mettant en scène des protistes. Je réunirai notre conseil scientifique prochainement pour discuter de la mise en œuvre éventuelle de ces diverses possibilités. Bien sûr, la participation de tous est souhaitée, et toute nouvelle idée est la bienvenue. Le dernier semestre a été marqué par le congrès européen de protistologie à St Pétersbourg au cours duquel Klaus Hausmann a été élu secrétaire de la Fédération (FEPS). Le premier congrès de la Fédération Réaumur (FRSV) a connu un brillant succès scientifique avec de nombreuses interventions de très haut niveau par des orateurs de grande renommée, succès qui ne s’est malheureusement pas traduit sur le plan financier. La dernière réunion du conseil de la FRSV a entériné le déficit (autour de 30 000 euros), et décidé de l’éponger en demandant le concours des différentes sociétés, ce qui s’est traduit par une participation de 3000 euros pour le GPLF. A l’avenir, une nouvelle structure du Conseil d’Administration de la FRSV sera mise en place : les présidents et trésoriers des sociétés participantes seront les membres de droit du conseil de la FRSV, et ils éliront parmi eux le président de la Fédération. Les futurs congrès de la Fédération auront une fréquence faible (la proposition de 4 ans semble avoir la préférence pour le moment), et ces congrès seront constitués par la juxtaposition des congrès annuels des sociétés membres, avec des symposiums transversaux pour assurer l’unité de la manifestation. L’année 2008 sera marquée par notre participation au congrès international de zoologie qui se tiendra à Paris du 26 au 29 Août (ICZ 2008, http://icz2008.snv.jussieu.fr/), et ce sera surtout l’année de notre congrès conjoint avec la société espagnole de protistologie à Séville, du 4 au 6 Juin. Un site internet est d’ores et déjà accessible pour toutes les informations concernant ce congrès : www.congreso.us.es/hfprotis. La langue officielle sera évidemment l’anglais pour des raisons pratiques. Bienvenue à tous … Loïc Morin

 

- Autres informations -

- Les résumés des présentations au congrès GPLF-SOAP de Dakar (2006) sont parus dans le Journal of Eukaryotic Microbiology, 54 (2), March-April 2007, 22S-28S. - XXIVe journée Jean-Claude Dreyfus : Relations Hôtes-Pathogènes, Institut Cochin, Paris, 21 Septembre 2007 (Axel KAHN coordonnateur) Affiche .pdf , Programme et Bulletin d'inscription - La réunion d’hiver de la Société Française de Parasitologie se tiendra à la Faculté de Médecine de Nice, les 13 et 14 décembre 2007 Affiche .pdf

- Assemblée Générale -

Compte rendu de l’assemblée générale du 29 Mai 2007 L’assemblée générale s’ouvre avec le résumé des comptes du GPLF, présenté par la trésorière. Les comptes sont positifs. Le bénéfice constaté est du au faible côut de la communication rendu possible grâce à internet et à l'excellente gestion des organisateurs de congrès sur ces 2 dernières années. Les résumés du congrès seront publiés gratuitement pour les membres dans le « Journal of Eukaryotic Microbiology », sous réserve que les auteurs envoient leur texte au bon format et dans les temps. Le GPLF accueille de nouveaux membres :. • Céline Fajon, Biologie des Protistes, UMR6023, Clermont-Ferrand. Parrains Philippe Bouchard et Geneviève Bricheux • Benjamin Morga, IFREMER, Génétique et Pathologie, La Tremblade.Parrains Isabelle Arzul et Geneviève Bricheux • Julien Santi-Rocca , Unité Biologie Cellulaire du Parasitisme, Institut Pasteur, Paris. Parrains Nancy Guillen et Dominique Mazier • Catherine Vaquero, INSERM U511, La Pitié-Salpétrière, Paris. Parrains Isabelle Desportes et Christian Vivares La présidente, Isabelle Desportes, fait le bilan des activités du GPLF pour 2004-2008. Relations avec d’autres sociétés: Le GPLF fait donc partie des sociétés fondatrices de la Fédération Réaumur des Sciences du Vivant (FRSV). Il a donné son accord pour faire partie de la nouvelle Fédération Européenne de Protistologie (EFP), présidée par Klaus Haussmann. Le site web du groupement, créé et mis à jour par Geneviève Bricheux, est régulièrement consulté. Prochains congrès prévus : ** Saint Pétersbourg, 5ème congrès Européen de Protistologie et 1er congrès de la Fédération Européenne de Protistologie. 23-27 Juillet 2007 http://onlinereg.ru/site.php?go=70&page=369&lang=ENG ** 1er congrès de la FRSV : Grenoble, 28-31 Octobre 2007 www.reaumur.org/rubrique.php3?id_rubrique=122 Deux sessions organisées par le GPLF : Symposium Relations hôtes-organismes (Loic Morin), workshop Apoptose et parasites (Philippe Grellier). ** Le prochain congrès du GPLF se déroulera à Séville en tant que congrès joint avec le Grupo Especializado de Protozoología SEM, à l’initiative d’Eduardo Villalobo, secrétaire du groupement espagnol (4-7 Juin 2008) www.congreso.us.es/hfprotis. Renouvellement du bureau et du conseil : Isabelle Desportes ne souhaite pas se représenter à la présidence. Loic Morin se porte candidat. Anne Aubusson-Fleury et Philippe Grellier acceptent de se représenter pour un nouveau mandat dans leurs fonctions respectives (Secrétaire et secrétaire adjoint). Geneviève Bricheux accepte de se représenter comme trésorière. Philippe Bouchard accepte de se présenter en tant que commissaire aux comptes. Voici une liste de candidats ayant donné leur accord pour les postes de conseillers . Sina ADL (Dalhousie University, Canada) Christian AMBLARD (Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand) Isabelle ARZUL (IFREMER, La Tremblade) Patrick BASTIEN (Montpellier) Philippe BASTIN (Institut Pasteur, Paris) Frédéric DELBAC (Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand) Michel DOLLET (CIRAD, Montpellier) Laure GUILLOU (Station Biologique de Roscoff) Ian PAWLOWSKI (Université de Genève, Suisse) Bhen Sikhina TOGUEBAYE (Université de Dakar, Sénégal) Catherine VAQUERO (Inserm U511, Paris) Eduardo VILLALOBO (Université de Séville, Espagne) Un débat s’ouvre au sujet du rôle du GPLF dans la communication de l’information sur les Protistes. Philippe Grellier expose son projet de promouvoir la protistologie à travers une exposition protistes au Muséum d’histoire naturelle. Le principe serait de lancer le projet, et de voir ensuite la réalisation si les instances sont intéressées. En ce qui concerne la banque d’images, maintes fois discutée en assemblée générale, deux nouvelles possibilités s’offrent pour l’indexage d’images de protistes : il s’agit des bases de données de Roscoff (http://planktonnet.sb-roscoff.fr/index.php) et de P. Patterson (http://starcentral.mbl.edu/microscope/portal.php?pagetitle=index). A priori, il n’y a pas de problème de copyright si l’image est en basse résolution. A chaque auteur de mettre le ou les logos nécessaires. Le rôle du GPLF dans cette réalisation pourrait être de motiver les auteurs à déposer leurs images, et de proposer un site rassemblant un maximum de sources d’information. Philippe Grellier rappelle qu’une des vocations du muséum est de pérenniser les documents. Mais il faut pour cela que les données soient triées et archivées. Il y a actuellement un projet consistant à archiver correctement les nouvelles espèces (documents descriptifs, images, et publication associées). Le muséum a détaché du personnel sur ce projet. Jean Génermont signale que le congrès international de zoologie se tiendra en Juin 2008. Il demande si le GPLF a été contacté. Loic Morin a effectivement été contacté par Jean-Marc Jallon et une journée devrait être organisée par le GPLF : deux parties : génôme (organisateurs : E. Villalobo et L. Morin), et écologie (C. Amblard). La séance est levée à 21h54.

- DIVERS -

- - -Nous vous informons que le site Groupement des Protistologues de Langue Française (GPLF) (http://www.univ-bpclermont.fr/ASSOC/gplf/) est référencé par le CIRS.FR, site internet du Centre International de Recherche Scientifique (CIRS), dans la rubrique . - - -Le CIRS.FR est un portail scientifique de référence à dimension internationale. Il propose des ressources scientifiques accessibles au grand public comme aux chercheurs : l'actualité de la recherche scientifique, une base de données de toutes les institutions de recherche dans le monde (universités, centres de recherche, laboratoires, sociétés savantes…) classées par pays et par thèmes, un annuaire de chercheurs, journaux et magazines, prix et récompenses, bibliothèques et librairies, ainsi que des ouvrages de référence dans toutes les disciplines… CIRS : http://www.cirs.fr Direction de la Communication Web (DCW) dcwcirs@cirs.fr B.P. 53 - 75222 PARIS Cedex 05 – FRANCE Fax : 33 1 43 31 29 75 E-mail : a.delorme@cirs.fr

Une petite galerie de photos spécial Roscoff

- Résumé de Thèse -

Lamjed Mansour

Date de soutenance : 16 juin 2007 Spécialité : génétique et parasitologie moléculaire Directeurs de thèse : Oum Kalthoum Ben Hassine et Christian Vivares Laboratoires d'accueil : UMR 6023 Laboratoire de Biologie des Protistes. Université Blaise Pascal. Les Cézeaux 63177 Aubière Cedex UR de Biologie Ecologie et Parasitologie des Organismes Aquatiques, Faculté des Sciences de Tunis, Université Tunis El-Manar, Tunisie

Les microsporidies parasites de poissons des côtes tunisiennes et françaises : structure des foyers infectieux et dynamique des génomes

- - Les microsporidies sont des parasites intracellulaires qui infestent plusieurs animaux, essentiellement des insectes et des poissons. Chez ces derniers, plus de 150 espèces, regroupées en 14 genres, ont été décrites. Dans la plupart des cas, la structure du foyer infectieux est structuré sous la forme d'un kyste, appelé xénome ou granulome. La caractérisation des microsporidies a été basée, depuis longtemps, uniquement sur des critères structuraux. Dans notre étude, nous avons essayé d'appliquer des approches, différentes mais complémentaires, pour l'étude de microsporidies récoltées sur les côtes tunisiennes et françaises. Dans un premier temps, nous avons effectué une recherche de microsporidies chez plus de 1400 poissons téléostéens, appartenant à 19 espèces, collectés au niveau de différents secteurs du littoral tunisien. Deux espèces microsporidiennes ont été récoltées. La caractérisation, à l'échelle de l'espèce, a été effectuée selon des méthodes structurales, basées sur la microscopie photonique, photonique à fluorescence et électronique à transmission. Elle a été complétée par des méthodes moléculaires (séquençage partielle de l'ADNr 16S) et des analyses phylogénétiques. Ces études nous ont permis de décrire une nouvelle espèce, Microgemma tincae, parasite du crénilabre Symphodus tinca mais aussi de mettre en évidence la présence de la microsporidie Spraguea lophii chez des lottes pêchées en Tunisie. - - Les études histopathologiques des foyers infectieux et la détermination des paramètres parasitologiques quantitatifs nous ont permis d'évaluer l'impact de ces parasites sur l'hôte et de connaître les différentes phases de l'évolution des xénomes et des granulomes. Malgré les différences observées dans la forme des foyers infectieux des deux espèces microsoridiennes étudiées, la succession des stades évolutifs du xénome au granulome est similaire pour les deux microsporidies. - - Dans la deuxième partie, nous avons entrepris une étude génomique, basée sur l'électrophorèse en champs alternés mono- et bidimensionnelle, de quelques microsporidies. Outre les deux espèces rencontrées en Tunisie, deux autres microsporidies, récoltées en France, ont été aussi ciblées par cette étude. Il s'agit de Glugea atherinae, parasite de l'athérine,Atherina boyeri et Spraguea lophii, prélevé sur la lotte atlantique, Lophius budegassa. Dans cette étude, les caryotypes moléculaires ont été réalisés par électrophorèse en champs alternés (PFGE). La correspondance entre les bandes caryotypiques, les molécules chromosomiques et la ploïdie a été déduite à partir des empreintes, bande par bande, moyennant un protocole original, basé sur la PFGE bidimensionnelle (KARD 2D-PFGE). Des hybridations avec des sondes d'ADNr nous ont permis de déterminer la distribution de ces gènes dans les chromosomes et d'apprécier leur relation avec la variabilité génomique. Les résultats obtenus ont abouti à une caractérisation très fine des génomes de Glugea atherinae et de Spraguea lophii. La première espèce présente un statut diploïde et stable alors que la seconde possède un statut haploïde et très variable. La mise au point d'un protocole d'extraction de l'ADN génomique nous a permis d'affiner cette étude à l'échelle du foyer infectieux et d'entreprendre une recherche sur la relation entre la dynamique du génome de Spraguea lophii et le développement du foyer infectieux dans l'hôte. - - La troisième partie a été consacrée au développement d'une méthode d'acquisition et de traitement d'images générées par la méthode KARD. Nous avons, en effet, obtenu une intégration complète de l'analyse numérique des KARD en utilisant un radio-chromatoimageur (RCI), basé sur la chambre à fils proportionnels (ou MWPC) et le logiciel PDQuest TM (Bio-rad), initialement conçu pour des analyses protéomiques. Mots clés: Microsporidies parasites des poissons, Microgemma tincae, microscopie, ADNr, foyer infectieux, caryotype moléculaire, PFGE, KARD, radioisotopes, bêta-imageur, PDQuestTM

 

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